تشارك فرق أكاديمية الأهلي في بطولات البراعم التي تنظمها منطقة القاهرة لكرة القدم، وشاركت الأكاديمية في الموسم الماضي بفريق واحد لكل من مواليد 2006 و 2007 وبفريقين لكل من مواليد 2008 و2009 و2010، كما شاركت فرق الأكاديمية الموسم الماضي في بطولة نادي الصيد الدولية للبراعم. يتم تنظيم بطولة دوري داخلي لكل فرع من فروع الأكاديمية، ثم تقام مسابقة دوري بين كل الفروع، وتوزع الجوائز على الفرق الفائزة من كل مرحلة سنية في ختام الموسم، وخلال الموسم يتم تقييم مستويات اللاعبين بشكل مستمر. تقام مباريات ودية بين فرق أكاديمية الأهلي وفرق قطاع الناشئين بالنادي ويتم من خلالها انتقاء أفضل العناصر المميزة في الأكاديمية وضمها لقطاع الناشئين.
تم افتتاح أول فروع الأكاديمية في يوليو 2006 بفرع النادي الأهلي بمدينة نصر، وتضم الأكاديمية الآن 15 فرعاً على مستوى الجمهورية والدول العربية. فروع أكاديمية الأهلي القاهرة: النادي الأهلي بمدينة نصر. نادي «دايموند» بالقطامية. نادي حلوان العام. الجيزة: ملاعب مدرسة السعيدية الثانوية. النادي الأهلي بالشيخ زايد. السويس: نادي النصر للبترول. الدقهلية: استاد جامعة المنصورة. الإسكندرية: مدرسة فيكتوريا كوليدج. مدرسة بايونيرز. الشرقية: مركز شباب أبو كبير. أسيوط: استاد جامعة أسيوط. سوهاج: مدرسة سيتي. أسوان: استاد أسوان الرياضي. فرع دولة الإمارات. فرع دولة الكويت.
تنظم أكاديمية الأهلي يومًا عائليًا بشكل دوري بمشاركة أولياء أمور اللاعبين، كما يقام يوم افتتاحي للموسم بحضورهم، وفي نهاية الموسم يقام اليوم الختامي، ويتم خلاله توزيع الجوائز وشهادات التقدير على اللاعبين.
